畸形精子症通过药物治疗、手术矫正等方法来改善，一般不难治疗。

畸形精子症主要是生殖道感染、内分泌紊乱等原因导致的，这些疾病可通过药物治疗缓解，如抗生素治疗可减少感染引起的炎症反应，激素调节可以恢复正常的内分泌状态。对于少数因染色体异常引起者，则需要考虑辅助生殖技术，如体外授精-胚胎移植等。

如果患者存在严重的精子形态学缺陷或合并有严重少弱畸精子症，且病因明确为遗传因素，则可能较难治愈。

针对畸形精子症的治疗需个体化方案制定，并结合生活方式调整如戒烟酒、规律运动等。同时，应避免接触有害物质以降低环境影响。