子宫内膜异位囊肿很少发生癌变，一般恶变率小于1%。

子宫内膜异位囊肿主要是由于子宫内膜细胞种植在卵巢上引起的，而这些细胞与正常的子宫内膜细胞相比，其生物学行为有所不同，因此更容易受到某些致癌因素的影响。但是，由于大多数患者的免疫监视系统能够有效地识别和清除异常细胞，所以发生癌变的风险相对较低。此外，对于存在子宫内膜异位囊肿的患者，建议定期进行相关检查，以便早期发现并处理可能存在的风险。

虽然子宫内膜异位囊肿通常不会癌变，但并不能完全排除这种可能性。如果囊肿较大或伴有症状，应密切监测以减少癌变风险。

针对子宫内膜异位症及其相关囊肿，建议采取非手术治疗如激素疗法，并注意避免过度劳累、保持心情愉悦等良好生活习惯，有助于控制病情发展。若出现不适症状或囊肿增大等情况，应及时就医评估是否需要手术干预。