新生儿感染巨球红细胞病毒后，由于机体免疫系统不完善，无法有效清除病毒，导致病毒持续复制并扩散，引起肝脏和脾脏的炎症反应和水肿，表现为肝脾肿大。

巨球红细胞病毒感染可导致肝脏和脾脏的炎症反应，此时会刺激这两种器官产生更多的白细胞来对抗感染，从而引起肝脾肿大的现象。此外，该病原体还可能影响血液中的红细胞，使其数量异常增多，进一步加重了肝脾肿大的症状。

如果新生儿出现黄疸、贫血或嗜睡等症状，则需要高度警惕巨球红细胞病毒感染引起的并发症。

在诊断为巨球红细胞病毒感染时，应密切监测患儿的症状变化，并遵循医生的治疗方案以减少长期健康风险。