苯丙酮尿症有轻度至重度的智力残疾后遗症，但可以通过早期识别和治疗来减轻症状。

苯丙酮尿症是由于基因突变导致的氨基酸代谢紊乱，如果不及时治疗，会导致脑内神经递质合成受阻，进而影响大脑发育，出现智力残疾等问题。但是通过新生儿筛查及早期干预，如限制高苯丙氨酸食物摄入，可有效控制血浆中苯丙氨酸浓度，防止其对中枢神经系统造成不可逆损害。

苯丙酮尿症患者可能需要定期监测血液中的苯丙氨酸水平，并在医生指导下调整饮食。

严重时，可能会引起癫痫发作、运动障碍等并发症。

家长应密切关注患儿的症状变化，特别是在治疗开始后的前几个月，以确保症状得到改善或没有恶化。必要时，应在专业医师的指导下调整治疗方案。