先天性膈疝手术后一般没有后遗症，也不会复发。

先天性膈疝通过手术修复膈肌缺陷，恢复正常的解剖结构，从而预防了腹腔内脏器进入胸腔。因此，术后通常不会出现后遗症。但是，为了确保手术效果和减少风险，需要在专业医生指导下进行术后管理，并定期随访。

极少数情况下，如果患者存在膈肌发育不全或与周围组织粘连严重等情况，可能会影响手术效果，增加后遗症发生的风险。

此外，对于巨大疝或伴有严重并发症者，术后可能出现肺部感染、胸腔积液等并发情况。

膈疝手术是一项较为复杂的手术，需由经验丰富的外科医师进行。术后应密切监测呼吸功能和胸部状况，以早期发现并处理任何潜在的问题。