支原体尿路感染可以挂泌尿外科、皮肤性病科、呼吸内科、感染科或急诊科。由于支原体尿路感染涉及泌尿系统和呼吸系统，建议在医生指导下使用阿奇霉素或多西环素进行治疗。
1.泌尿外科
泌尿外科主要诊治与泌尿系统相关的问题，包括肾脏、输尿管、膀胱等部位的疾病。支原体尿路感染涉及泌尿系统的健康，因此可以到泌尿外科进行治疗。在泌尿外科可进行尿常规、B超等检查以评估病情。
2.皮肤性病科
皮肤性病科专门处理各种皮肤及附属器官疾病的诊断和治疗，包括但不限于梅毒、尖锐湿疣等。若患者存在尿道口瘙痒等症状，且考虑为非淋菌性尿道炎所致，则应至皮肤性病科就医。在皮肤性病科可通过暗视野显微镜检查或核酸检测来确认是否存在特定微生物感染。
3.呼吸内科
呼吸内科专注于肺部、支气管及其他上呼吸道疾病的诊断和管理。如果患者的支原体尿路感染是由下呼吸道感染扩散导致的，则需要前往呼吸内科就诊。在呼吸内科，医生可能会建议进行胸部X光、CT扫描或痰液培养等检查以辅助诊断。
4.感染科
感染科针对由细菌、真菌或其他微生物引起的感染性疾病提供诊疗服务。当支原体尿路感染伴有发热、乏力等全身症状时，此时则需去往感染科就诊。在感染科，通常会采集尿液样本进行培养以确定致病微生物种类，并指导抗生素使用。
5.急诊科
急诊科负责处理急性、突发的医疗状况，包括但不仅限于尿路感染。对于疑似支原体尿路感染伴随严重症状如血尿、剧烈腰痛者，应立即前往最近的急诊室接受紧急评估和治疗。急诊医师会对患者进行全面体检并抽取尿液标本送检，同时可能开具处方以便快速获得适当的药物治疗。
患者在治疗期间要保持充足的水分摄入，促进细菌排出。同时避免过度疲劳，保证充足睡眠，以增强机体免疫力，有利于疾病的恢复。
