肾囊肿一般不会直接影响肾功能，但如果囊肿较大或伴有并发症，则可能会对肾功能产生一定的影响。

肾囊肿是常见的肾脏良性疾病，通常生长缓慢，不会直接破坏肾单位，因此不会引起明显的肾功能损害。但是，如果囊肿体积过大或者压迫周围组织，会导致局部血液循环障碍，从而影响肾小球的功能，进一步引发尿液排泄不畅、蛋白尿等问题，最终导致肾功能减退。此外，若囊肿发生感染或破裂等并发症，炎症反应和尿液外渗也可能会加重肾损伤。

肾囊肿还可能伴随高血压、尿路梗阻等情况，此时会对肾功能造成额外的压力，加剧肾功能下降的风险。

对于肾囊肿患者，建议定期监测肾功能指标，及时发现并处理任何潜在的问题。同时避免使用可能增加肾脏负担的药物，保持健康的生活方式也有助于保护肾功能。