吃巧克力牙疼可能是龋齿、牙髓炎、牙周炎、牙龈炎或牙齿过敏导致的，需根据具体病因进行针对性治疗。建议患者及时就医，以便获得适当的治疗。

1.龋齿

由于细菌感染导致牙齿硬组织脱矿，形成蛀洞，当蛀洞深入到牙髓腔时会引起牙髓炎症反应，进而导致疼痛。补牙是常见的治疗方法，通过去除受损组织并填充材料如复合树脂来修复受损部位。

2.牙髓炎

牙髓受到细菌感染引起炎症，炎症刺激会导致牙髓组织水肿和渗出液增多，从而引起牙齿疼痛。此外，炎症还可能引起神经反射性头痛。根管治疗是一种常用的治疗方法，旨在清除受感染的牙髓组织并填充根管系统以防止再次感染。

3.牙周炎

牙周炎是由牙菌斑生物膜引起的牙周支持组织慢性炎症，炎症可导致牙槽骨吸收、牙龈红肿和出血，严重时可能导致牙齿松动甚至脱落。深部清洁是治疗牙周炎的一种方法，包括刮治和根面平整术等，旨在移除牙周袋内的菌斑和结石。

4.牙龈炎

牙龈炎由牙菌斑微生物群引起的牙龈组织炎症，如果不及时治疗，可能会导致牙龈红肿、出血和疼痛。龈下刮治是一种常见的治疗方法，旨在清除位于牙龈下方的牙石和菌斑。

5.牙齿过敏

牙齿过敏是由于牙釉质磨损或牙本质暴露导致的敏感性增加，当温度变化迅速时，冷热食物或饮料接触敏感区域会引起短暂但剧烈的疼痛。使用含氟牙膏刷牙可以增强牙釉质的硬度，减少敏感性。

建议定期进行口腔卫生维护，避免食用过硬或过冷的食物，以减少牙齿不适的发生。如有必要，患者还可以进行X线检查、探针检查以及口腔专业医师的临床评估。