霉菌性肠炎可以考虑使用氟胞嘧啶、酮康唑、咪康唑、氟康唑、伊曲康唑等药物进行治疗。但是，霉菌性肠炎是一种严重的疾病，需要及时就医并遵循医生的指导使用药物。

1.氟胞嘧啶

氟胞嘧啶适用于真菌感染引起的肠炎。该药物能特异性地渗入真菌细胞内，干扰其核酸合成。

肾功能减退患者需调整剂量。治疗期间应定期监测血常规和肾功能。

2.酮康唑

酮康唑可用于多种真菌感染所致的肠炎。本品可抑制真菌细胞膜上固醇类物质的生物合成，从而起到抑菌效果。肝功能不全者应慎用。服药期间不宜驾驶车辆或操作机器。

3.咪康唑

咪康唑也适用于真菌感染导致的肠炎。此药通过干扰细胞膜的结构及功能而发挥抗菌作用。妊娠期妇女禁用。哺乳期妇女使用时应停止哺乳。

4.氟康唑

氟康唑对于由念珠菌等真菌引起的小儿肠炎有治疗作用。本品为广谱抗真菌药，对多种真菌具有抗菌活性。严重免疫缺陷者长期大量服用本品可能导致机会性感染加重。建议进行血液学、肝功能检查。

5.伊曲康唑

伊曲康唑可以用于侵袭性真菌感染所引起的肠炎。本品能够高度选择性地抑制真菌细胞膜上麦角鲨烯环氧化酶，阻断真菌细胞膜主要组分羊毛甾醇的生物合成，损伤真菌细胞膜并影响真菌的代谢过程。孕妇及可能怀孕的妇女不应服用本品。哺乳期妇女如须服用本品，应暂停哺乳。

以上提及的所有药物均需要遵医嘱合理使用。患者在治疗霉菌性肠炎的同时，应注意个人卫生，保持肛周皮肤干燥清洁，以减少细菌滋生，促进病情恢复。