肛门大便困难伴有疼痛可能源于痔疮、肛裂等疾病。

上述提及的疾病均会导致肛门局部血液循环受阻或者肛管黏膜破损，从而引起排便时的疼痛以及排便困难的情况发生。当患者出现肛门疼痛及排便困难的症状时，应及时前往医院就诊，以便明确诊断并接受适当治疗。

如果患者的症状持续或加重，可能需要进一步的检查，例如直肠指诊、肛门镜检查或结肠传输试验，以排除其他潜在病因，如肠道梗阻、巨球蛋白血症等。

日常生活中应注意保持良好的饮食习惯，避免食用辛辣刺激性食物，如辣椒、生姜等，以免加重不适症状。此外，还应多喝水，有助于促进肠道蠕动，预防便秘的发生。