整肠生会对肝肾产生轻微影响，但不会引起明显的副作用。

整肠生中的有益菌群能够抑制有害菌过度繁殖，减少毒素产生，从而减轻肝脏解毒压力；另外，该药物可以促进营养物质吸收，降低尿素循环负荷，进而缓解肾脏工作量。

长期或过量使用整肠生可能会导致肠道微生态失衡，因此需要在医师指导下使用。

在服用整肠生期间，应避免与抗生素同时使用，以防止对抗生素敏感菌株的过度生长。

此外，对于存在肝肾功能不全者，在使用整肠生时需谨慎，并定期监测肝肾功能。