三个月宝宝缺钙可能表现为夜间烦躁、颅骨软化、肋骨串珠、胸骨凹陷和生长迟缓等症状，建议及时就医以评估和治疗缺钙情况。

1.夜间烦躁

由于缺钙导致神经兴奋性增高，大脑皮层兴奋度增强，从而出现夜间烦躁的症状。当缺钙时会导致中枢神经系统处于异常状态，进而影响睡眠质量，导致夜间频繁醒来并伴随烦躁情绪。

2.颅骨软化

缺钙会影响骨骼发育，导致颅骨骨质密度下降，硬度降低，容易变形和软化。颅骨软化通常发生在头顶区域，新生儿期更为明显，可伴有头部畸形。

3.肋骨串珠

缺钙导致肋骨矿化不全，在生长过程中形成圆形隆起，即串珠样改变。串珠状改变通常出现在两侧肋骨前端，随着年龄增长可能逐渐变得平坦。

4.胸骨凹陷

缺钙引起的佝偻病可能导致胸廓畸形，胸骨向内凹陷是其中的一种表现形式。胸骨凹陷多见于胸骨中部，有时伴有呼吸困难或其他胸部不适。

5.生长迟缓

缺钙会影响机体新陈代谢和组织器官发育，进而影响身高增长速度。生长迟缓表现为婴儿体重增加缓慢，身高低于同龄儿童平均值。

针对上述症状，建议进行血液中钙离子浓度检测以及维生素D水平测定。

治疗措施包括补充钙剂和维生素D制剂，如葡萄糖酸钙口服溶液和维生素AD滴剂。家长还要注意观察孩子的饮食均衡，确保摄入足够的钙和维生素D，同时适当带孩子晒太阳以促进钙吸收。