婴儿吃益生菌大便发黑可能是正常反应，也可能是胃溃疡、十二指肠溃疡等疾病的表现，需要结合具体情况进行评估。

益生菌有助于改善肠道菌群失衡，促进食物消化吸收，减少便秘的发生，从而可能导致大便颜色变浅。但同时也会刺激胃黏膜，引起少量出血，血液在肠道中经过氧化作用形成黑色物质，导致大便发黑。胃溃疡、十二指肠溃疡等疾病会导致胃肠黏膜受损，出现呕血、黑便等症状，此时服用益生菌可能会加重病情，所以会出现上述表现。

如果宝宝除了大便发黑外还伴有腹泻、腹痛等症状，则可能与药物无关，需考虑是否为消化道出血所致。

家长平时应注意观察孩子的大便性状和颜色变化，若发现异常应及时就医，并完善相关检查以确定原因。此外，在使用益生菌时应遵循医生指导，避免盲目用药造成不良后果。