药物流产孕囊没有排出时，如果阴道流血量不多，可以遵医嘱使用促进子宫收缩药物进行处理，如缩宫素注射液、米索前列醇片等。若阴道流血量较多，则需及时刮宫终止妊娠。

因为药物流产后孕囊没有排出会导致阴道流血量增多，严重时会引起贫血甚至休克，所以需要通过刮宫术来清除宫腔内的残留组织，从而达到止血的目的。在医生指导下进行刮宫手术可有效减少风险，并确保安全。

如果患者在药物流产后出现腹痛或发热等症状，可能表明存在感染的风险，此时应立即就医以获得适当的抗生素治疗。

总之，药物流产后未见孕囊排出的情况下，应高度警惕可能出现的并发症，并密切监测身体变化。建议患者定期复查，如有不适症状应及时到医院就诊。