肠镜不可以检查肛瘘。

肠镜主要是用于检查肠道疾病的一种内窥镜检查方式，能够清晰地观察到大肠黏膜的情况，但并不能够看到肛门部位是否存在异常病变。而肛瘘需要通过医生的手指触摸以及肛门视诊等方式来判断，必要时也可以遵医嘱使用碘伏消毒后涂抹甲硝唑凝胶、克林霉素软膏等药物进行治疗，以免延误病情。

如果患者存在严重的便秘或腹泻症状，可能会影响直肠和结肠的功能状态，进而影响诊断结果的准确性。

在进行肠镜检查前，应避免食用含纤维素丰富的食物，以减少肠道内容物的影响；同时注意保持肛周清洁卫生，以免增加感染风险。