新生儿肛门直肠畸形可采取肛门成形术、腹腔镜辅助下肛门直肠畸形修复术、肠道菌群调整、营养支持治疗等方法进行治疗。

1.肛门成形术

肛门成形术通过手术建立人工肛门以恢复排泄功能。

主要适用于单纯性肛门闭锁、膜状闭锁等简单类型的肛门直肠畸形。

2.腹腔镜辅助下肛门直肠畸形修复术

腹腔镜辅助下肛门直肠畸形修复术是利用内窥镜技术在腹部微小切口下进行的微创手术，对病变部位进行修复。此方法主要用于复杂型肛门直肠畸形的矫正。具有创伤小、恢复快的优点。

3.肠道菌群调整

通过使用益生菌制剂来改善肠道微生物平衡，促进正常消化吸收功能的恢复。对于部分无法耐受传统饮食结构的患儿是一种有益补充手段。

4.营养支持治疗

营养支持治疗旨在提供全面均衡的营养成分，包括碳水化合物、脂肪、蛋白质及维生素、矿物质等，以满足生长发育需要。当患者存在严重营养不良或其他并发症时，应考虑给予高能量密度配方奶粉或特殊医学用途配方粉。

术后需密切观察伤口愈合情况及是否有感染迹象。同时，定期复查是非常必要的，以便及时发现并处理任何可能出现的问题。