孕妇肛门湿疣可以考虑采取中药外敷、激光治疗、冷冻治疗、电灼治疗、光动力疗法等方法进行治疗。由于孕期的特殊性，建议在专业医生指导下进行治疗，并密切监测病情变化。

1.中药外敷

通过外敷具有清热解毒、活血化瘀功效的中药，如黄连、黄柏等，可以缓解症状。

适用于轻度肛门湿疣患者，可作为辅助治疗手段。

2.激光治疗

利用高能量密度激光瞬间产生的高温使病变组织气化或结痂脱落，达到去除湿疣的目的。适合表浅且数量较少的湿疣。

3.冷冻治疗

低温能使病变组织冻结坏死，从而达到去除湿疣的效果。对于体积较小、位置较深的湿疣有效。

4.电灼治疗

用电流产生高温的方式直接破坏病变组织，快速止痒。主要针对单个较大或突出体表的湿疣。

5.光动力疗法

使用特定波长的光源激活体内摄取的光敏剂，进而引起局部细胞死亡。主要用于治疗难治性或复发性肛门湿疣。

孕期患肛门湿疣需谨慎处理，以减少对母婴的影响。除上述提及的方法外，还可考虑采用非处方药膏如水杨酸软膏进行局部治疗，但必须在专业医生指导下使用。