扁平疣通常不会自行消失，因为其由人乳头瘤病毒感染引起，并且具有传染性。

人乳头瘤病毒感染会导致皮肤上出现微小破损，使病毒得以进入并复制。

这种病毒能够潜伏于皮肤中，不断繁殖并形成新的疣体，因此无法自行消除。如果不及时治疗，扁平疣可能会扩散到身体其他部位，增加治疗难度和成本。

此外，若患者免疫状态低下或存在共用个人用品等行为时，可能会影响自身病情恢复。

针对扁平疣的治疗，建议患者可以遵医嘱使用维A酸类外用药膏，如他扎罗汀凝胶、阿达帕林凝胶等药物局部涂抹，也可以通过冷冻治疗的方式进行处理。