先天性胆总管囊肿手术后遗症可能包括腹痛、腹部不适、胆管炎、胆汁淤积性肝硬化、消化不良等症状，如果这些症状持续存在或加重，应尽快就医。

1.腹痛

先天性胆总管囊肿手术后，由于局部炎症刺激或者术后并发症如狭窄等可能导致腹痛的发生。腹痛可能位于上腹部或右上腹部，疼痛程度可轻可重。

2.腹部不适

腹部不适可能是由术后瘢痕组织形成、胃肠功能紊乱等原因导致的。

不适感通常集中在上腹部，有时伴随恶心、呕吐等症状。

3.胆管炎

胆管炎是由先天性胆总管囊肿引起的胆道梗阻和感染所致，此时炎症因子会刺激胆管壁，引发胆管炎。胆管炎的症状包括右上腹绞痛、发热、黄疸等，严重时可能出现寒战高热。

4.胆汁淤积性肝硬化

胆汁淤积性肝硬化是先天性胆总管囊肿的一种后遗症，肝脏长期受到胆汁的损害会导致纤维化和结构改变。患者可能会出现乏力、瘙痒、皮肤黄色染色等症状。

5.消化不良

消化不良可能与手术后的胃肠道功能障碍有关，影响食物的正常消化吸收。消化不良表现为饭后上腹部饱胀、嗳气、腹泻等症状。

针对先天性胆总管囊肿的术后情况，可以进行超声波检查以评估胆管的情况。对于上述提及的所有症状，建议及时就医并接受专业医生的评估和治疗。日常生活中，应避免食用辛辣、油腻的食物，保持规律的饮食习惯，有助于减少症状发生的风险。