急性结膜炎滴眼药水后结膜反而变红可能是用药不当、病情发展等原因引起的。

由于结膜受到炎症因子刺激而发生充血，此时如果盲目用药，如错误使用激素类眼药水，可能导致炎症进一步加重，从而使结膜颜色加深。此外，如果患者的病情正处于活动期，炎症处于活跃状态，也可能因药物作用不明显而导致结膜持续充血。当出现结膜充血时，需要及时停用该眼药水，并到医院就诊，以便进行针对性治疗。

患者在患上急性结膜炎期间，除了遵医嘱使用妥布霉素滴眼液外，还可能伴随眼部疼痛、分泌物增多等不适症状。这些症状可能表明疾病的进展或感染加重。

针对急性结膜炎，患者应避免接触已污染的眼部用品，以免传播病原体，同时保持良好的个人卫生习惯。在治疗过程中，若发现眼部症状加剧或其他不适反应，应及时告知医生调整治疗方案。