由于疾病的种类不同，所以患者进行肛门指检还是肠镜检查并没有哪一种好的说法，具体选择需根据患者的病情决定。当患者出现肛门、肠道的病变时，建议及时到医院就诊，由医生明确疾病种类，再选择相应的检查方式。
1、肛门疾病：如痔疮、肛裂、肛周脓肿等，进行肛门指检可以直接观察到肛门是否存在病变。而肠镜主要可以观察肠道是否存在病变，同时还可以观察到整个肠道的病变情况;
2、肠道疾病：如溃疡性结肠炎、肠道结核、肠道肿瘤、阿米巴肠病等。通过肛门指检可以直接观察到肠道是否存在溃疡、占位、炎症等情况。而肠镜检查可以通过全面观察肠道内部，较为仔细地观察肠道是否存在病变，还可以观察到肠道是否存在出血、狭窄、息肉等情况;
3、肛门、肠道以外疾病：如腹股沟疝气、脐疝、子宫脱垂等，通过肛门指检可以触及到病变部位。而腹股沟疝气主要可以触摸到腹股沟处有明显的包块，而脐疝主要可以在肚脐处摸到膨出的包块。此外，肠道肿瘤在进行肛门指检时，可以触摸到质地较硬的肿块。而子宫脱垂则可以通过肛门指检触及子宫的位置。
无论是肛门指检还是肠镜检查，都需要前往正规医院进行。在进行这项检查时，可以充分了解肛门、肠道的具体情况，以便于医生对于疾病进行正确的诊断及治疗。
