慢性咽喉炎引起头疼可能是长期烟酒刺激、反流性食管炎、慢性扁桃体炎、咽部神经反射性头痛、恶性肿瘤等病因导致的，需根据具体因素进行针对性治疗。建议患者及时就医，以便获得适当的治疗。

1.长期烟酒刺激

长期烟酒刺激会导致黏膜充血水肿和分泌物增多，从而引起慢性炎症。

戒烟限酒是治疗的关键，可以减轻症状并促进康复。

2.反流性食管炎

反流性食管炎是由胃酸或其他消化液反流至食管引起的炎症，可导致喉咙疼痛、吞咽困难等症状。患者可在医生指导下使用雷贝拉唑钠肠溶片、奥美拉唑肠溶胶囊等药物进行治疗。

3.慢性扁桃体炎

慢性扁桃体炎由急性扁桃体炎反复发作或未彻底治愈转化而来，此时由于局部存在病灶，因此可能会诱发免疫反应，出现发热、咽痛、口臭、扁桃体肿大等不适症状。若病情持续发展，则容易形成慢性疾病状态。针对此病症，通常需要遵医嘱采用复方氯己定含漱液、复方硼砂含漱液等含漱以缓解不适症状。

4.咽部神经反射性头痛

咽部神经反射性头痛是指咽部受到刺激后，通过三叉神经反射到头部引起的头痛。对于这类头痛，建议减少吸烟和饮酒，同时注意休息，避免过度疲劳。

5.恶性肿瘤

恶性肿瘤可能压迫周围组织结构，包括颈部淋巴结、血管和神经，进而引发疼痛。确诊需进行活检分析，治疗方案可能涉及手术切除、放疗或化疗。

患者应定期复查，监测病情变化，如电子喉镜检查、X线检查以及CT扫描等。此外，保持良好的生活习惯，如均衡饮食、适量运动和充足睡眠，有助于改善症状并促进健康恢复。