男性根部长了个肉疙瘩疼可能是毛囊炎、皮脂腺囊肿或阴茎癌导致的。

上述提及的疾病均属于良性病变，但如果不及时治疗，都有可能发展为恶性肿瘤。

因此，为了避免病情恶化，需要尽快就医以便获得准确诊断和适当治疗。

如果患者在龟头部位出现有红斑、丘疹、水疱等，并伴有瘙痒、疼痛等症状，则有可能是龟头炎引起的。此外，还可能存在生殖器疱疹、接触性皮炎等皮肤疾病的可能性。

针对男性根部出现肉疙瘩且伴有疼痛的症状，建议避免自行搔抓或挤压，以免加重炎症或造成感染扩散。同时，应保持局部清洁干燥，穿着透气舒适的内裤，以促进患处恢复。