唇腭裂通常是由遗传和环境因素共同作用导致的。
唇腭裂的发生涉及到多个基因的表达异常，这些基因在胚胎发育过程中控制着口腔颌面部结构的形成。遗传研究发现，特定的基因突变与唇腭裂风险增加有关，如FGFR2、IRF6等。此外，孕期吸烟、酗酒、药物滥用以及母亲怀孕期间接触放射线或其他化学物质都可能导致胎儿发生畸变，从而增加唇腭裂的风险。
唇腭裂还可能与其他并发症共存，如牙槽裂、硬腭裂或软腭裂等。这进一步增加了管理和治疗的复杂性。
预防唇腭裂的关键是优化孕前和孕期保健，包括均衡饮食、避免有害物质暴露，并接受定期产前检查。对于有家族史者，应特别关注孕期风险因素，以便及时干预。
