衣原体感染尿道未及时治疗经过规范治疗后通常能治好。

衣原体属于条件致病菌，在人体免疫力下降时可引起局部或系统性感染。虽然其具有一定的耐药性，但通过抗生素治疗仍可被根除。因此，尽管感染初期未能得到及时处理，只要在确诊后立即开始抗生素疗程，通常能够有效控制病情，并达到治愈的目的。

若患者存在多重耐药基因扩增，则可能导致治疗失败。因为这些细菌可以快速变异产生耐药性，使得传统抗生素对其无效。

由于衣原体感染可通过性传播，建议患者在治疗期间避免性接触以防止感染扩散。同时，患者应保持良好的个人卫生习惯，包括勤洗手、穿宽松透气的内衣裤等，有助于减少感染风险。