九价HPV疫苗不能直接预防扁平疣，但可降低由高危型HPV感染导致相关疾病的概率。
九价HPV疫苗主要是用于预防人乳头瘤病毒感染所诱发的相关疾病，如宫颈癌、阴茎癌等。而扁平疣是由低危型HPV3、10等感染引起的皮肤病变，因此该疫苗并不能直接预防扁平疣的发生。但是由于九价HPV疫苗可以覆盖多种高危型HPV，从而减少由其引发的疾病，间接起到一定的保护作用。
扁平疣还可能与自身免疫状态有关，若患者存在免疫缺陷或长期处于免疫抑制状态，则可能增加患扁平疣的风险。
接种九价HPV疫苗前应确保不存在对该疫苗任何成分过敏的情况，并在注射后观察局部反应和个人身体变化。注意保持良好的个人卫生习惯，避免与他人共用个人用品以减少交叉感染的可能性。
