囊肿手术后疼痛的恢复时间因个体差异而异，通常在数天至数周之间。囊肿大小和位置是影响疼痛恢复的主要因素。

囊肿手术后疼痛是指由于手术引起的局部组织损伤和炎症反应导致的疼痛，通常需要一定时间才能缓解。若囊肿较小且位置表浅，手术过程中对周围组织的损伤较小，术后疼痛的恢复时间通常较短，可能在数天内即可缓解。

对于囊肿较大或位置较深的患者，手术过程中需要切开更多的组织，术后疼痛的恢复时间可能会相应延长，可能需要数周时间。此外，若患者有合并症，如糖尿病，可能会延长疼痛的恢复时间。

术后患者应遵循医嘱，避免剧烈运动和重压患处，以促进伤口愈合和减轻疼痛。