胃肠炎患者在医生指导下服用奥美拉唑是有效的。

奥美拉唑是一种质子泵抑制剂，能够有效地抑制胃酸的生成，减轻胃酸对胃黏膜的刺激和损伤，促进胃黏膜修复，从而改善胃肠炎患者的症状。但是，胃肠炎还可能伴随腹泻等症状，因此，在使用奥美拉唑时，需要结合具体病情和医嘱进行调整。

如果患者存在严重的消化道出血、肠梗阻等并发症，则不建议使用奥美拉唑治疗，以免加重病情。

在治疗胃肠炎期间，患者应注意饮食调理，避免辛辣、油腻食物，保持充足的水分摄入，以减少胃肠道负担，有利于疾病的恢复。