早上起来尿很黄伴有微痛可能是肝胆疾病引起的。

肝胆疾病患者的肝细胞受到损伤，导致胆红素代谢障碍，血液中的胆红素水平升高，随着血液循环流入肠道时会被转化成胆汁，然后通过胆管进入十二指肠，再随食物残渣排出体外，在这个过程中，部分未被吸收的胆汁会经过肾脏过滤进入尿液中，使尿液呈现黄色。同时，由于炎症反应或其他病理变化，患者可能会感到轻微的腹痛或不适，从而出现尿黄伴随微痛的情况。

建议进行肝功能检查、血清胆红素检测以及腹部超声波检查以确定诊断。

如果患者存在长期饮酒、药物滥用等不良生活习惯，可能导致肝脏受损，进而影响胆红素的代谢与排泄，引起尿液变黄的现象。此外，若患者存在肝硬化等慢性肝病，也可能会因肝脏合成和分泌胆汁的功能下降，导致胆汁淤积而引发上述症状。

针对这种情况，患者应注意保持良好的生活习惯，避免过度劳累和情绪紧张，保证充足的睡眠时间，并定期监测尿液颜色的变化。若症状持续不缓解或者伴有其他不适，应及时就医以便进行进一步的评估和治疗。