药物引起胃肠功能紊乱可以考虑采取中药调理、益生菌制剂、胃黏膜保护剂、肠道微生物群恢复、心理行为疗法等方法进行治疗。如果症状持续或加重，应及时就医以获得专业治疗。

1.中药调理

通过服用具有健脾胃、促消化功效的中成药来改善症状。对于因长期用药引起的轻微胃肠功能紊乱患者有一定的缓解效果。

2.益生菌制剂

补充有益细菌以恢复肠道微生态平衡。适用于由抗生素使用导致的菌群失调引起的轻度胃肠不适。

3.胃黏膜保护剂

在受损部位形成一层保护层，减少胃酸和胃蛋白酶对黏膜的损伤。用于缓解由非甾体抗炎药等引起的胃部不适及胃黏膜损伤。

4.肠道微生物群恢复

通过调整饮食结构或口服特定配方奶粉来重建正常菌群平衡状态。针对因长期用药导致的微生态环境改变而引发的腹泻等问题有效。

5.心理行为疗法

采用认知重构、放松训练等技巧帮助患者减轻压力，从而缓解由精神因素造成的胃肠功能紊乱。适合那些因生活事件如工作压力大、人际关系紧张等原因导致胃肠功能紊乱的个体。

在处理药物引起的胃肠功能紊乱时，应首先停用可能引起症状的相关药物。同时，建议增加膳食纤维摄入量，保持规律作息，并根据具体病因选择合适的治疗方案。