先天性肛门闭锁的手术费用因个体差异而异，通常在1万元至3万元之间。具体价格差异可能与病情复杂程度、是否伴有其他先天畸形有关。

先天性肛门闭锁是一种罕见的消化道畸形，由于直肠盲端位置异常导致肛门无法正常排泄。该疾病需要通过手术治疗，以建立正常的肠道连续性和恢复排便功能。如果患者只是简单的肛门闭锁，没有其他并发症或合并症，那么手术费用相对较低。对于复杂的肛门闭锁病例，例如伴随有直肠发育不全或其他泌尿系统畸形，则会导致手术难度增加，从而提高手术成本。

在考虑先天性肛门闭锁手术时，应关注医院的专业水平以及医生的经验丰富程度，以确保获得比较好的医疗效果和合理的花费。