治疗甲状腺囊肿的药物包括甲巯咪唑、丙硫氧嘧啶、左旋甲状腺素、阿替洛尔、普萘洛尔等。由于甲状腺囊肿的复杂性，建议在专业医生的指导下使用这些药物，并定期监测甲状腺功能。

1.甲巯咪唑

甲巯咪唑适用于Graves病引起的甲状腺功能亢进症。该药物能抑制甲状腺合成甲状腺激素。

服药期间应定期监测甲状腺功能和肝功能。

2.丙硫氧嘧啶

丙硫氧嘧啶可用于各种类型的甲状腺功能亢进症。此药通过抑制甲状腺过氧化物酶活性，从而阻断碘化酪氨酸的缩合，干扰甲状腺激素的合成。对本品过敏者、严重肝损害患者禁用。

3.左旋甲状腺素

左旋甲状腺素用于甲状腺功能减退导致的甲状腺囊肿。其可以纠正缺乏的甲状腺激素，改善相关症状。起始剂量需小，逐渐增加至有效剂量以减少心脏风险。

4.阿替洛尔

阿替洛尔可缓解甲状腺功能亢进引起的心悸等症状。此药为β受体拮抗剂，能够降低心率和血压，减轻甲状腺亢进所致的症状。哮喘及慢性支气管炎患者慎用。

5.普萘洛尔

普萘洛尔对于控制甲状腺功能亢进患者的高血压有帮助。它是一种非选择性β-肾上腺素受体拮抗剂，具有降压效果。服用时应注意可能出现头晕、乏力等不良反应。

针对甲状腺囊肿，患者可在医生指导下使用甲巯咪唑、丙硫氧嘧啶进行治疗。同时，建议患者保持良好的生活习惯，保证充足的睡眠时间，有利于病情恢复。