急性肾盂肾炎主要由革兰氏阴性菌引起，其中以大肠埃希菌最为常见。

急性肾盂肾炎是由于细菌侵入尿路而引发的感染性疾病，通常发生于膀胱炎后。大肠埃希菌是最常见的尿路致病菌之一，其产生的内毒素可直接损伤肾盂黏膜，导致炎症反应。此外，该菌能产生酶类破坏尿路上皮细胞屏障，促进其黏附和定植，进一步加重感染。

除大肠埃希菌外，还可能有变形杆菌、克雷伯杆菌等革兰氏阴性菌存在。

在诊断或治疗急性肾盂肾炎时，应考虑不同类型的致病菌，并采取相应的抗生素治疗措施。同时，患者应注意多饮水、勤排尿，避免憋尿，以减少细菌滞留和繁殖的机会。