肺炎链球菌肺炎患者咳铁锈色痰可能是由于病原体产生的内毒素诱导炎症反应、肺泡壁增厚、肺水肿、肺组织坏死以及肺部纤维化等病理改变导致的。这些病理变化会导致痰液呈现铁锈色，需要及时就医并接受相应治疗。

1.病原体产生的内毒素诱导炎症反应

当肺炎链球菌侵入人体时，其产生的内毒素可以刺激机体免疫系统产生炎症反应。这会导致呼吸道黏膜充血、肿胀，从而引起咳嗽。

患者需要及时使用抗生素进行抗感染治疗，如青霉素V钾片、阿莫西林胶囊等药物控制病情发展。

2.肺泡壁增厚

由于炎症因子的作用，肺泡壁会发生炎性细胞浸润和组织损伤，进而导致肺泡壁增厚。针对此现象，可遵医嘱服用复方甲氧那明胶囊、氨溴特罗口服溶液等具有止咳作用的药物缓解不适症状。

3.肺水肿

肺水肿是由于肺毛细血管通透性增高，液体漏出至肺间质和肺泡内积聚所致。此时由于肺泡内液体增多，使得呼吸困难加重并伴有咳嗽。对于肺水肿引起的咳嗽，患者可在医生指导下通过吸氧的方式改善不适症状。

4.肺组织坏死

肺组织坏死是指肺组织受到严重损伤后出现死亡的现象，可能导致气道分泌物增加，从而引起咳嗽。如果是由细菌感染引起的，则可以在医生指导下使用头孢克肟颗粒、盐酸左氧氟沙星胶囊等抗生素类药物进行抗感染治疗。

5.肺部纤维化

肺部纤维化是一种慢性炎症性疾病，主要表现为肺组织结构紊乱和瘢痕形成。这些瘢痕组织可能会对肺部造成压迫和限制，导致呼吸困难和咳嗽。患者需要到正规医院就诊，在医生指导下使用吡非尼酮胶囊、乙磺酸尼达尼布软胶囊等药物延缓病情进展。

建议定期监测体温变化，同时注意休息，保持充足的睡眠时间，以利于身体恢复。饮食上宜清淡易消化，避免辛辣刺激性食物，以免加重呼吸道不适。