扁桃体炎与咽炎的药物治疗可能存在差异，通常需要针对具体病情选择合适的药物。

虽然扁桃体炎与咽炎均属于上呼吸道感染疾病，但其病因、症状及治疗方法有所不同。扁桃体炎多由细菌感染引起，常伴有化脓性分泌物，此时可使用抗生素如阿莫西林克拉维酸钾进行抗感染治疗；而咽炎则可能是病毒或其他因素导致的，一般不需用抗生素，主要通过清热解毒类中成药如蒲地蓝消炎口服液缓解症状。因此，在选用药物时应考虑上述差异以确保针对性治疗。

在急性发作期，患者还可遵医嘱服用非甾体抗炎药如布洛芬来缓解疼痛，或使用含漱剂如复方氯己定溶液进行口腔护理。

在治疗扁桃体炎和咽炎期间，患者应注意休息，避免辛辣刺激性食物，保持充足的水分摄入，并按医嘱完成整个疗程以促进痊愈。