包涵体性结膜炎的治疗可以考虑抗生素治疗、抗病毒治疗、免疫调节治疗和中医药疗法。如果病情没有改善或者加重，应尽快就医以获得专业的诊断和治疗。

1.抗生素治疗

抗生素通过抑制细菌生长或杀死细菌来对抗感染。例如，妥布霉素可以用于革兰氏阴性菌引起的包涵体性结膜炎。当诊断明确为细菌感染时，妥布霉素可用于外眼及泪道感染。使用前需评估患者是否有对氨基糖苷类药物过敏史。

2.抗病毒治疗

抗病毒药物能够干扰病毒复制过程，从而控制病情发展。利巴韦林可阻断RNA合成，具有广谱抗病毒活性。利巴韦林适用于多种病毒感染性疾病，如呼吸道合胞病毒感染。但需注意肝功能损害者慎用。

3.免疫调节治疗

免疫调节剂能调整机体免疫应答状态，以达到治疗目的。环孢素可通过抑制T细胞介导的炎症反应发挥作用。环孢素可用于自身免疫性疾病等引起的包涵体性结膜炎。使用时需监测肾功能和血压变化。

4.中医药疗法

中医药疗法通过平衡体内阴阳、调理气血来缓解症状。如黄连、黄芩有清热解毒的作用，可辅助改善结膜炎症状。对于体质虚弱、反复发作的包涵体性结膜炎患者，可在医生指导下服用上述中药。

在治疗包涵体性结膜炎的过程中，应注意保持良好的眼部卫生习惯，避免接触可能引起感染的物品，以免加重病情或影响治疗效果。