小脑扁桃体下疝是否会引起头痛取决于个体差异及病情严重程度。

小脑扁桃体下疝是指小脑的一部分向下移位进入枕骨大孔，当其仅表现为轻度下疝时，通常不会直接压迫延髓、第四脑室等重要结构，因此很少会出现头痛等症状。但重度下疝则可能造成脑干受压，此时就可能出现频繁发作的头痛。

如果患者存在颅内高压或伴有其他神经系统疾病，则可能会增加头痛的风险。

因为这些因素都可能导致脑脊液循环不畅，从而引起颅内压力增高，进而引发头痛。

在关注小脑扁桃体下疝的同时，应注意观察患者的头痛频率与性质变化，避免过度劳累和情绪紧张，保持良好的睡眠质量，以减少症状的发生。