先天颅骨缺失5公分属于较大的颅骨缺损，需要及时手术修复。

先天颅骨缺失5公分是由于胚胎期颅骨缝过早愈合所致，如果不进行修补，可能会对大脑造成压迫，引发一系列并发症，如脑积水、脑萎缩等，严重时甚至会危及生命。因此，建议尽早到医院神经外科就诊，通过CT检查明确诊断后，遵医嘱进行修补手术。

除了上述提及的主要原因外，还应考虑是否存在颅内感染或肿瘤引起的继发性颅骨缺损。

这些疾病可能导致颅腔压力不均，进而引起颅骨变形或缺损。

在处理先天颅骨缺失的情况下，应注意避免剧烈运动以减少头部震动，同时遵循医生的建议进行适当的康复训练，以促进身体恢复。