流行性乙型脑炎的后遗症包括意识障碍、运动障碍、吞咽困难、肌肉萎缩和癫痫发作，这些症状需要及时就医以获得专业治疗。

1.意识障碍

流行性乙型脑炎是由乙型脑炎病毒感染引起的中枢神经系统感染性疾病，在病毒侵袭大脑皮层和间脑时，会导致神经细胞受损，从而影响正常的思维活动。当炎症累及到大脑皮质时，会导致意识障碍。意识障碍通常表现为昏迷、嗜睡或清醒状态下的认知功能下降等现象，可能伴有不同程度的意识水平改变。

2.运动障碍

由于乙型脑炎病毒侵犯脊髓前角细胞和脑干神经核以及大脑运动皮质锥体细胞、皮层下白质神经纤维等部位，导致上述部位受损，进而出现运动障碍的症状。患者可能会出现肢体无力、瘫痪、痉挛等症状，这些症状可能会影响患者的日常生活活动能力。

3.吞咽困难

乙型脑炎病毒会直接损害延髓的呼吸循环中枢、颅内血管运动中枢、基底动脉系统等部位，使这些部位的功能发生障碍，进而引发吞咽困难的现象。吞咽困难可能导致食物反流、误吸甚至窒息的风险增加，严重时可导致营养不良和脱水等问题。

4.肌肉萎缩

乙型脑炎病毒侵入人体后，通过血液循环进入中枢神经系统，大量繁殖后产生血栓形成、水肿等情况，导致神经细胞变性和坏死，进而引起周围神经损伤，导致肌肉萎缩的发生。肌肉萎缩通常表现在四肢近端，如大腿和手臂，也可能涉及面部肌肉，导致肌力减退和肌肉体积减少。

5.癫痫发作

乙型脑炎后遗症中，部分患者会出现慢性脑部炎症反应，这种炎症反应可能导致异常放电灶形成，从而引起癫痫发作。癫痫发作可以突然发生，通常伴随着意识丧失、抽搐和尿失禁等症状，持续时间从几秒到几分钟不等。

针对流行性乙型脑炎的后遗症，建议进行头颅MRI、脑电图等检查以评估病情。治疗措施包括抗病毒药物，如阿昔洛韦、更昔洛韦等，以及康复训练。患者应保持充足休息，避免过度疲劳，同时遵循医嘱完成疫苗接种计划，预防乙型脑炎病毒感染。