包茎患者龟头上出现小疙瘩且伴有疼痛症状，多考虑是龟头炎、尖锐湿疣等疾病所致，需要针对具体病因进行针对性处理。

1. 龟头炎：由于包茎导致龟头与内裤过度摩擦，加之局部清洁不彻底，易诱发龟头炎，表现为龟头上的小疙瘩以及疼痛感。患者可在医生指导下使用克霉唑乳膏、盐酸特比萘芬乳膏等药物进行治疗。

2. 尖锐湿疣：主要是由人乳头瘤病毒感染引起的性传播疾病，通常发生在生殖器及肛门附近，典型症状为生殖器上出现颗粒状、菜花状的赘生物，还可伴有疼痛、瘙痒等症状。本病主要通过性接触传播，建议患者可遵医嘱使用咪喹莫特乳膏、氟尿嘧啶软膏等药物进行治疗。

3. 睾丸鞘膜积液：如果患者的病情比较严重，还可能会对阴囊造成压迫，使阴囊内的血液循环受阻，进而引发睾丸鞘膜积液的发生，此时也会出现上述不适症状。对于无明显症状的患者，一般无需进行特殊治疗，定期复查即可。对于有明显症状者，可通过手术的方式进行治疗，如鞘膜翻转术、鞘膜切除术等。

4. 肿大的淋巴结：如果患者存在泌尿系统疾病，如前列腺炎、附睾炎等，也可能会导致肿大的淋巴结，从而引起上述不适症状。如果是细菌感染引起的，可配合医生服用抗生素类药物进行治疗，比如左氧氟沙星片、阿奇霉素片等；若是病毒感染导致的，可以按医嘱使用利巴韦林颗粒、磷酸奥司他韦胶囊等抗病毒药物进行调理。

5. 其他：包括毛囊炎、阴虱病等，这些疾病也可导致类似症状。患者应积极寻找并消除诱因，并遵循医嘱采取相应措施，如保持患处干燥清洁、穿着透气舒适的内衣裤等。

针对不同病因引起的龟头小疙瘩伴随疼痛的情况，其治疗方法各异。因此，建议患者及时就医以确定确切诊断，并接受专业指导和治疗。

除以上原因外，还有可能是阴茎癌导致的，需警惕。如确诊为阴茎癌，则需要配合医生通过手术方式将病变组织完整地切除。

在日常生活中，患者应注意个人卫生，避免使用刺激性强的肥皂或洗涤剂清洗患处。同时还要调整饮食结构，尽量减少辛辣刺激性食物的摄入量，以免加重皮肤炎症反应。