肾小管间质肾炎肾萎缩是因为长期的慢性炎症导致肾小管损伤，进而影响肾功能，使肾单位逐渐丧失其正常的功能，最终导致肾萎缩的发生。
肾小管间质肾炎是由多种原因引起的以肾间质为主要发病部位的一组疾病。当患者存在肾小管间质肾炎时，可能会出现肾小管上皮细胞坏死脱落，此时会释放出一些炎症因子，这些炎症因子又会刺激周围的结缔组织增生，进而形成纤维化，导致肾间质发生纤维化改变，随着时间的推移，肾间质会被纤维组织所替代，从而使肾小管间质发生纤维化，进而导致肾萎缩的情况发生。
此外，如果患者的病情没有得到及时有效的治疗，肾脏受到持续的损害，也可能会引起肾萎缩的现象。
在临床上，对于肾小管间质肾炎肾萎缩的患者，需要避免使用可能加重肾损害的药物，并注意保持充足的水分摄入，以促进废物的排泄。
