儿童小便时刺痛，可能由于尿路感染、尿道结石、包皮龟头炎、尿道肉阜等因素引起。建议家长带儿童及时就医，完善相关检查，结合临床症状明确诊断。
1、尿路感染：常由于儿童不注意个人卫生、饮水少等因素导致。正常的尿液由肾脏产生，通过输尿管从膀胱排出体外。当儿童不注意个人卫生或饮水少时，便可能导致尿路感染的发生，出现儿童小便时刺痛的症状，还可伴有尿频、尿急、尿不尽等症状;
2、尿道结石：可由于遗传因素、环境因素等导致，儿童的尿道较短，易受到外界因素的侵袭。当儿童在小便时，尿液会对结石产生刺激，引起刺痛的症状，还可伴有排尿困难、尿急等症状;
3、包皮龟头炎：多由于包皮过长或包茎导致，可使包皮内板与阴茎头之间发生粘连。在小便时尿液刺激包皮以及阴茎头，从而引起刺痛感，还可伴有瘙痒、渗出等症状;
4、尿道肉阜：多由于尿道下端黏膜皱襞增生并向尿道口外突出形成息肉导致。当儿童在小便时，尿液会对息肉产生刺激，从而引起局部刺痛感，可伴有出血、溃烂等症状。
除上述情况外，如果存在泌尿系统肿瘤，当肿瘤体积增大时，会对局部组织造成压迫，引起局部组织刺痛。
