肛瘘手术后可能会复发。

肛瘘的发生与多种因素有关，如肛周脓肿、肛裂等，而手术仅能切除可见病变部位，对于潜在的病因并不能治疗。

因此，如果不注意个人卫生、存在不良生活习惯或患有相关基础疾病，则容易诱发疾病的复发。

术后患者应定期复查以监测病情变化，及时发现并处理可能的复发情况。

术后患者应注意保持局部清洁干燥，避免便秘和腹泻，以减少肛瘘复发的风险。