先天性卵巢发育不全不能自然怀孕。

先天性卵巢发育不全属于一种遗传性疾病，主要是由X染色体异常所致，会导致体内激素水平紊乱，影响正常的月经周期以及卵子的生成与排出，进而影响生育能力。此外，此类患者的子宫也存在一定的缺陷，不利于胚胎着床和生长发育，因此难以实现自然怀孕的目的。

虽然先天性卵巢发育不全患者无法自然受孕，但可以尝试使用促排卵药物诱导排卵，如氯米芬、来曲唑等，以增加怀孕机会。

对于先天性卵巢发育不全的女性，建议定期进行妇科检查，监测激素水平变化，及时发现并处理可能存在的并发症。对于有生育需求者，可考虑通过辅助生殖技术如试管婴儿进行受孕。