肛裂肛门指检是否疼痛与病情严重程度有关，轻微者一般不痛，严重者可有疼痛。

轻度肛裂通常仅伴有少量出血和轻微疼痛，因此在指检时不会引起明显的不适感。严重的肛裂可能导致肛门括约肌痉挛或狭窄，增加指检时的疼痛阈值，从而使疼痛更加显著。此外，如果存在感染或其他并发症，也可能导致指检时的不适感加重。

患者可能因为紧张、恐惧或既往经历创伤性事件而加剧指检时的疼痛反应。这些因素可能会使肌肉紧张度增高，从而放大疼痛感受。

在进行肛裂肛门指检前，应保持肛门区域清洁，并告知医生任何可能影响检查舒适性的特殊情况，以减少不必要的疼痛。