精子质量差一般不会导致孕酮低。

精子质量主要反映男性生育能力，而孕酮水平则反映了女性的黄体功能及子宫内膜状态，两者之间并没有直接的关系。

如果患者存在甲状腺功能减退、多囊卵巢综合征等疾病时，也可能会出现孕酮低的现象。因为这些疾病会影响下丘脑-垂体-性腺轴的功能，进而影响孕酮的合成与分泌。

在考虑精子质量与孕酮水平之间的关系时，应注意排除其他可能引起孕酮低下的原因，并建议定期监测双方的身体状况，以确保生殖健康。