肛门指检和肛门镜检查未发现肛瘘表明可能性较低，但不能完全排除。
肛瘘通常需要通过专业医师的肛门指检和肛门镜检查来确诊，如果未发现异常，一般情况下不会是肛瘘。但是，由于肛瘘的症状和其他疾病的症状相似，有时可能会出现误诊或漏诊的情况，所以建议患者及时复诊或做进一步的影像学检查以确定诊断。
在极少数情况下，某些特殊类型的肛瘘可能难以通过常规检查被发现，例如高位复杂性肛瘘、隐匿性肛瘘等。这些肛瘘位置较高或分支较多，可能与周围组织结构紧密相连，因此难以被常规检查所发现。
总之，在诊断肛瘘时，应综合考虑患者的临床表现和辅助检查结果，避免过度依赖某一种检查方法造成漏诊或误诊。对于疑似肛瘘的患者，应及时就医并接受全面评估。
