新生儿巨结肠在及时发现并接受治疗的情况下，通常是可以治愈的，并不影响预期寿命。

巨结肠主要是因为直肠及结肠远端的肠管肌间神经丛发育不全或者消失所致，该病会导致肠管蠕动功能减弱甚至丧失，进而引起排泄困难。经过治疗性的手术切除病变肠段后，一般能够恢复正常的功能，不会影响生长发

育以及生活质量。

如果巨结肠伴随严重的并发症，如肠穿孔、肠梗阻等，则可能需要更复杂的治疗措施，此时预后相对较差。

由于新生儿巨结肠可能伴有肠道感染等问题，在治疗过程中需密切监测患儿的生命体征，同时注意营养支持与维持水电解质平衡。