妇科肛门指检时感到疼痛可能是由于肛门括约肌痉挛、局部感染引起的。
肛门括约肌痉挛在进行肛门指检时会刺激到敏感的肛门括约肌，导致其发生短暂的痉挛性收缩，从而引起疼痛。局部感染则是因为指检过程中可能造成细菌进入肛周区域，引发局部炎症反应，产生疼痛症状。
如果患者既往有痔疮或直肠息肉等疾病史，则在进行肛门指检时可能会因为触碰到病变部位而出现轻微不适感。此外，若存在肛裂或肛窦炎等情况，也可能因指检引起一定程度上的疼痛。
总之，在进行妇科检查时，应告知医生任何不适感，以确保检查结果准确可靠。同时注意保持良好的个人卫生习惯，避免使用刺激性强的清洁用品，以免影响肛门健康。
