长了卵巢囊肿，尿液发黄，考虑可能与饮水过少、药物因素、感染、尿路结石等因素有关。建议及时前往医院的妇科或泌尿外科就诊，明确病因后，积极进行治疗。

1、饮水过少：卵巢囊肿患者如果每天饮水量过少，可能会导致尿液浓缩，出现发黄的情况。一般不需要特殊治疗，适当增加饮水量即可;

2、药物因素：卵巢囊肿患者通常需要长期服用药物，如屈螺酮炔雌醇片、左炔诺孕酮片等。药物可能会导致体内激素代谢异常，从而引起尿液发黄的症状。建议患者在医生指导下调整用药，或者停止药物服用;

3、感染：如果卵巢囊肿患者不注意私处卫生，引起致病菌侵袭，出现感染的情况，可能会引起尿路感染，从而出现尿液发黄、尿频、尿急等症状。患者可以在医生指导下，根据药敏试验结果选择抗生素药物进行治疗，如注射用头孢曲松钠、阿莫西林胶囊等;

4、尿路结石：如果卵巢囊肿患者出现尿路结石，如输尿管结石等，结石会随着机体移动不断摩擦尿路黏膜，可能会损伤尿路黏膜，导致出血，从而出现尿液发黄、血尿、排尿困难等症状。此时可以在医生指导下口服排石颗粒、枸橼酸氢钾钠颗粒等药物进行治疗，也可以选择体外冲击波碎石术进行治疗。

此外，卵巢囊肿癌变的情况较为少见，当卵巢囊肿癌变时，肿瘤细胞侵袭周围组织，可能会导致局部黏膜破损出血，从而出现尿液发黄、阴道分泌物增多、下腹部疼痛等不适症状。建议在医生的指导下通过手术切除的方式进行治疗，术后根据病理结果选择放化疗。